一是纳税人销售零税率货物根据税法规定具有纳税的义务，但由于规定税率为零，纳税人不用负担税款。而免税则指国家根据政策的需要，免除纳税人缴纳税款的义务。

二是纳税人销售零税率货物既然有纳税义务，同样具有抵扣税额的权利，从形式上表现为退给纳税人在各个流转环节已缴纳的税款。而免税则规定免除纳税人纳税的义务，同时也规定生产销售免税货物不得抵扣进项税额，也即纳税人必须放弃抵扣税款的权利。

因此，不应将零税率和免税混为一谈，二者是有本质区别的。

一句话总结：零税率，进项税额可以抵扣（形式上表现为退税）；免税，进项税额不能抵扣。

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